Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Siah3B2RWG3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Siah3B2RWG3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms