Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cfap58B2RW38 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cfap58B2RW38 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms