Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Usf3B2RUQ2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Usf3B2RUQ2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Usf3B2RUQ2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Usf3B2RUQ2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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Usf3B2RUQ2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usf3B2RUQ2 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usf3B2RUQ2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Usf3B2RUQ2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usf3B2RUQ2 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usf3B2RUQ2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Usf3B2RUQ2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Usf3B2RUQ2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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