Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Prrt4B2RU40 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Prrt4B2RU40 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms