Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
JrklB2RRL2 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
JrklB2RRL2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms