Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC6

Cad, CAD protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CadB2RQC6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CadB2RQC6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CadB2RQC6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CadB2RQC6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms