Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brpf3B2KF05 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Brpf3B2KF05 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Brpf3B2KF05 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms