Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CK137956B1AYM9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CK137956B1AYM9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms