Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Nipsnap3aB1AWZ3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms