Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PtpruB1AUH1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PtpruB1AUH1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms