Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Trabd2bB1ATG9 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trabd2bB1ATG9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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