Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Spocd1B1ASB6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Spocd1B1ASB6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms