Protein–RNA interactions for Protein: B1APN4

Rhox1, Reproductive homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox1B1APN4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Rhox1B1APN4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rhox1B1APN4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms