Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Tmem238A9JSM3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Tmem238A9JSM3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms