Protein–RNA interactions for Protein: A7XUX6

Skint2, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint2A7XUX6 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Skint2A7XUX6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Skint2A7XUX6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms