Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm3173A6NAS3 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm3173A6NAS3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms