Protein–RNA interactions for Protein: A6H619

Phrf1, PHD and RING finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phrf1A6H619 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phrf1A6H619 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Phrf1A6H619 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phrf1A6H619 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Phrf1A6H619 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Phrf1A6H619 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phrf1A6H619 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Phrf1A6H619 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Phrf1A6H619 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
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