Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E4

Ttll2, Probable tubulin polyglutamylase TTLL2, mousemouse

Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll2A4Q9E4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll2A4Q9E4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll2A4Q9E4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll2A4Q9E4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll2A4Q9E4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll2A4Q9E4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll2A4Q9E4 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Ttll2A4Q9E4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttll2A4Q9E4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttll2A4Q9E4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttll2A4Q9E4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttll2A4Q9E4 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttll2A4Q9E4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttll2A4Q9E4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttll2A4Q9E4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttll2A4Q9E4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttll2A4Q9E4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttll2A4Q9E4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Ttll2A4Q9E4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Ttll2A4Q9E4 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms