Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Odf2A3KGV1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Odf2A3KGV1 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms