Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gm6880A3KG45 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
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Gm6880A3KG45 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm6880A3KG45 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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Gm6880A3KG45 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6880A3KG45 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms