Protein–RNA interactions for Protein: A2ASJ1

Pramef17, PRAME family member 17, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef17A2ASJ1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pramef17A2ASJ1 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pramef17A2ASJ1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms