Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Scn3aA2ASI5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Scn3aA2ASI5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms