Protein–RNA interactions for Protein: A2APC3

Ttll9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll9A2APC3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ttll9A2APC3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ttll9A2APC3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ttll9A2APC3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms