Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Syndig1A2ANU3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Syndig1A2ANU3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms