Protein–RNA interactions for Protein: A2ALW2

Zkscan16, Zinc finger with KRAB and SCAN domains 16, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan16A2ALW2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan16A2ALW2 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan16A2ALW2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan16A2ALW2 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan16A2ALW2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan16A2ALW2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan16A2ALW2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Zkscan16A2ALW2 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan16A2ALW2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan16A2ALW2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan16A2ALW2 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan16A2ALW2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan16A2ALW2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan16A2ALW2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Zkscan16A2ALW2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Zkscan16A2ALW2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zkscan16A2ALW2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zkscan16A2ALW2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zkscan16A2ALW2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zkscan16A2ALW2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zkscan16A2ALW2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Zkscan16A2ALW2 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan16A2ALW2 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan16A2ALW2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan16A2ALW2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan16A2ALW2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan16A2ALW2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan16A2ALW2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan16A2ALW2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan16A2ALW2 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan16A2ALW2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Zkscan16A2ALW2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms