Protein–RNA interactions for Protein: A2A8M8

Pramef6, PRAME family member 6, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef6A2A8M8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Pramef6A2A8M8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Pramef6A2A8M8 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pramef6A2A8M8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pramef6A2A8M8 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms