Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PtprfA2A8L5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms