Protein–RNA interactions for Protein: A2A863

Itgb4, Integrin beta-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb4A2A863 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itgb4A2A863 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Itgb4A2A863 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.9 ms