Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cul4bA2A432 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cul4bA2A432 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms