Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nlrp1bA1Z198 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nlrp1bA1Z198 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms