Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Ccdc173A0JLY1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ccdc173A0JLY1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms