Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms