Protein–RNA interactions for Protein: A0A140LIX9

Cfap99, Cilia and flagella-associated protein 99, mousemouse

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Length 648 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap99A0A140LIX9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap99A0A140LIX9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap99A0A140LIX9 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap99A0A140LIX9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cfap99A0A140LIX9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap99A0A140LIX9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap99A0A140LIX9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap99A0A140LIX9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap99A0A140LIX9 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap99A0A140LIX9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfap99A0A140LIX9 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfap99A0A140LIX9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
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