Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms