Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trbv26A0A0B4J1P5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trbv26A0A0B4J1P5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trbv26A0A0B4J1P5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trbv26A0A0B4J1P5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trbv26A0A0B4J1P5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Trbv26A0A0B4J1P5 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Trbv26A0A0B4J1P5 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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Trbv26A0A0B4J1P5 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Trbv26A0A0B4J1P5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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