Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trbv30A0A0B4J1P1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv30A0A0B4J1P1 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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