Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B694

Trav14-2, T cell receptor alpha variable 14-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav14-2A0A075B694 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trav14-2A0A075B694 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Trav14-2A0A075B694 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trav14-2A0A075B694 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Trav14-2A0A075B694 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trav14-2A0A075B694 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trav14-2A0A075B694 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trav14-2A0A075B694 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trav14-2A0A075B694 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Trav14-2A0A075B694 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trav14-2A0A075B694 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trav14-2A0A075B694 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trav14-2A0A075B694 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trav14-2A0A075B694 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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