Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm30262-201ENSMUST00000219137 791 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 AC123665.4-201ENSMUST00000228790 249 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 RMST_1.1-210ENSMUST00000219606 2891 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Cenpi-201ENSMUST00000081064 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Snx10-207ENSMUST00000179365 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 3110099E03Rik-202ENSMUST00000134580 2644 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Slc17a8-201ENSMUST00000020102 4456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Cyp4a32-201ENSMUST00000084342 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Adam28-202ENSMUST00000111072 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Trub1-201ENSMUST00000026072 4300 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm765-201ENSMUST00000164491 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Efcab14-201ENSMUST00000074425 4300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm25758-201ENSMUST00000103987 129 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Obox4-ps38-201ENSMUST00000175961 724 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Prl-201ENSMUST00000018061 886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm17775-201ENSMUST00000198542 258 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm5554-201ENSMUST00000199726 1206 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Slc12a1-201ENSMUST00000028630 4645 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Myt1-202ENSMUST00000108756 5509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Sfmbt2-205ENSMUST00000116594 7821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Inpp5d-208ENSMUST00000167032 4125 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Pde1a-202ENSMUST00000102651 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Pde1a-201ENSMUST00000090756 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Muc15-201ENSMUST00000090332 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Osbpl9-214ENSMUST00000160774 2765 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Kcnip4-208ENSMUST00000176978 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Lcp2-201ENSMUST00000052413 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Efcab5-201ENSMUST00000108400 4654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm8595-201ENSMUST00000118250 630 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm12808-201ENSMUST00000120597 404 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm3053-201ENSMUST00000161709 616 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Calml4-202ENSMUST00000163820 699 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm20480-201ENSMUST00000173953 250 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm44604-201ENSMUST00000205475 496 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm7550-201ENSMUST00000223334 282 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Stra6l-203ENSMUST00000107783 3669 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Nwd1-204ENSMUST00000161254 10792 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Galnt13-201ENSMUST00000068595 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Maml2-201ENSMUST00000034401 2098 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 D330045A20Rik-202ENSMUST00000113030 3736 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 BC003331-204ENSMUST00000097547 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d24-213ENSMUST00000201805 3806 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gpr119-201ENSMUST00000053970 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Olfr721-ps1-203ENSMUST00000215479 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Pard3-203ENSMUST00000108752 3497 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Zfp27-201ENSMUST00000053521 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Olfr943-205ENSMUST00000215770 8308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r34-207ENSMUST00000228647 2979 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm42989-201ENSMUST00000200646 2306 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 A330015K06Rik-202ENSMUST00000195685 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr96-203ENSMUST00000214482 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm11184-201ENSMUST00000126437 268 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 1700041M05Rik-201ENSMUST00000130055 306 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm24295-201ENSMUST00000158298 131 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 1500015L24Rik-202ENSMUST00000179640 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Ighv1-45-201ENSMUST00000193677 352 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm44330-201ENSMUST00000200106 143 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm17992-201ENSMUST00000207346 1072 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm32817-201ENSMUST00000210007 689 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 AC131178.1-201ENSMUST00000228649 492 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr1257-201ENSMUST00000060795 1016 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Akr1c19-201ENSMUST00000081326 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.9 ms