Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Gm42531-201ENSMUST00000201648 4048 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Xpo1-204ENSMUST00000109551 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Olfr1079-202ENSMUST00000111582 2141 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm13870-201ENSMUST00000117214 1023 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Cbx3-ps3-201ENSMUST00000118595 550 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm12375-201ENSMUST00000119331 921 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm4234-201ENSMUST00000119747 714 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Rps12-ps1-201ENSMUST00000121980 401 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm15551-201ENSMUST00000132762 535 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gtsf1-206ENSMUST00000146675 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm12504-202ENSMUST00000148026 306 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm12148-201ENSMUST00000153791 292 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm6264-201ENSMUST00000160802 624 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm16297-201ENSMUST00000161466 459 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Dynlt1a-201ENSMUST00000169415 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm24465-201ENSMUST00000178398 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm29206-201ENSMUST00000189321 827 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Ighv6-2-201ENSMUST00000192430 295 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Ighv1-73-201ENSMUST00000197435 352 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm6649-201ENSMUST00000199743 1165 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm5318-201ENSMUST00000205249 406 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm44607-201ENSMUST00000205611 1090 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm31897-202ENSMUST00000206231 604 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm44690-201ENSMUST00000207984 382 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 5430437J10Rik-201ENSMUST00000211750 1234 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 4930542C16Rik-203ENSMUST00000212108 1207 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm35890-201ENSMUST00000221195 564 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 AC101205.1-201ENSMUST00000227916 907 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Frg1-201ENSMUST00000033999 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Olfr1474-201ENSMUST00000096202 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Olfr74-201ENSMUST00000099840 957 ntAPPRIS P1 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 AU023762-203ENSMUST00000209897 2179 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm38257-201ENSMUST00000195881 2761 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Iqub-201ENSMUST00000052277 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Prkg2-205ENSMUST00000162619 1308 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Olfr983-202ENSMUST00000213087 6196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Olfr25-202ENSMUST00000212354 1362 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Slamf6-207ENSMUST00000195656 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 9430062P05Rik-201ENSMUST00000192703 3345 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Larp4-201ENSMUST00000057632 6527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Fbxo3-202ENSMUST00000102565 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm11516-201ENSMUST00000118450 1582 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Usp29-204ENSMUST00000200535 7540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Scn2a-201ENSMUST00000028377 8935 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm44113-201ENSMUST00000203510 3041 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm26146-201ENSMUST00000104478 185 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm25346-201ENSMUST00000104509 128 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Taf7l-202ENSMUST00000113223 1155 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 A730017C20Rik-203ENSMUST00000118510 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm7494-201ENSMUST00000121248 441 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm24685-201ENSMUST00000157764 285 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm26211-201ENSMUST00000158578 129 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Mir7058-201ENSMUST00000184637 75 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Vmn1r189-201ENSMUST00000186062 1137 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm28149-201ENSMUST00000187102 378 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm28768-201ENSMUST00000189034 378 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm4856-201ENSMUST00000192696 1091 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm37871-201ENSMUST00000194973 688 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm31887-201ENSMUST00000197661 501 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm42824-201ENSMUST00000199361 247 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm17834-201ENSMUST00000204322 891 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Tecr-214ENSMUST00000212990 648 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Olfr1084-201ENSMUST00000216851 961 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 AC153370.1-201ENSMUST00000220296 635 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 Gm9237-201ENSMUST00000221499 548 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 AC158521.1-202ENSMUST00000224352 645 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Ercc8Q8CFD5 AC154718.1-201ENSMUST00000226676 250 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms