Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Adgrl3-203ENSMUST00000117253 4764 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Izumo3-201ENSMUST00000107108 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Olfr408-ps1-201ENSMUST00000121710 941 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Spink10-205ENSMUST00000162365 1076 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 2610027F03Rik-201ENSMUST00000185443 530 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 A430093F15Rik-206ENSMUST00000189565 651 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Fxyd4-207ENSMUST00000204214 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 4921513I08Rik-201ENSMUST00000206993 866 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm8523-201ENSMUST00000211386 552 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 AC153943.1-201ENSMUST00000219312 256 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Olfr651-201ENSMUST00000098176 1069 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Trove2-202ENSMUST00000159879 8738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Fanci-201ENSMUST00000036865 4645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Ceacam12-202ENSMUST00000108483 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Hlcs-209ENSMUST00000228910 4150 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm20075-201ENSMUST00000220449 2161 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 AC155634.1-201ENSMUST00000221687 2706 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Olfr1199-202ENSMUST00000124021 2967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm42756-201ENSMUST00000196601 2614 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Gm34481-201ENSMUST00000214968 3374 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Atg4aQ8C9S8 AC154755.2-201ENSMUST00000224384 2857 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Scn1a-201ENSMUST00000077489 8116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Tfpi-207ENSMUST00000111722 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm13641-201ENSMUST00000117993 473 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 1600025M17Rik-201ENSMUST00000138262 666 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Atg4aQ8C9S8 Cabcoco1-202ENSMUST00000166919 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Atg4aQ8C9S8 Gm43743-202ENSMUST00000198353 491 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm43946-201ENSMUST00000204058 886 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm38584-201ENSMUST00000207361 517 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Hspe1-ps1-201ENSMUST00000222955 330 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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Atg4aQ8C9S8 Vmn1r4-204ENSMUST00000227073 1695 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Atg4aQ8C9S8 Daw1-202ENSMUST00000065436 1349 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Enpp2-202ENSMUST00000167541 2664 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
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Atg4aQ8C9S8 Tlr1-201ENSMUST00000059349 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Atg4aQ8C9S8 Synj2bp-203ENSMUST00000163402 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Atg4aQ8C9S8 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Atg4aQ8C9S8 Gm12618-201ENSMUST00000121754 483 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm25782-201ENSMUST00000122526 289 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm15970-201ENSMUST00000160623 834 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Mir6989-201ENSMUST00000184812 65 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 E330013P04Rik-203ENSMUST00000190698 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Snurf-201ENSMUST00000194059 216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm43646-201ENSMUST00000199962 464 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm20426-202ENSMUST00000204789 399 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm44788-201ENSMUST00000207605 385 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 AC156801.1-201ENSMUST00000216158 493 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 AC153567.1-201ENSMUST00000218424 1263 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Sprr2k-201ENSMUST00000067102 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Olfr519-201ENSMUST00000084752 960 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Mgst1-201ENSMUST00000008684 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Ccr9-203ENSMUST00000166236 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 AC131667.1-201ENSMUST00000214665 2175 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm15713-201ENSMUST00000155900 1546 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Zmynd11-201ENSMUST00000062658 3796 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Olfr1006-202ENSMUST00000216084 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Atg4aQ8C9S8 Gm42781-201ENSMUST00000201317 2719 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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