Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Vmn1r70-201ENSMUST00000055847 897 ntAPPRIS P2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Vmn1r40-201ENSMUST00000075158 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Arpp21-231ENSMUST00000178410 3419 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Celf2-226ENSMUST00000183209 3852 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Ctnnd1-201ENSMUST00000036811 5126 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm43637-201ENSMUST00000202206 2926 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Mipol1-208ENSMUST00000153137 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm8369-201ENSMUST00000079855 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Ints9-201ENSMUST00000043914 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm21036-201ENSMUST00000207544 2611 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm23577-201ENSMUST00000103950 110 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm14845-201ENSMUST00000121259 306 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm17078-201ENSMUST00000167617 668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm17174-201ENSMUST00000178962 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 D530049I02Rik-201ENSMUST00000186582 562 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm42461-201ENSMUST00000198627 1150 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm44382-201ENSMUST00000198683 122 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm9057-201ENSMUST00000198791 296 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm34225-203ENSMUST00000206921 572 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Olfr643-202ENSMUST00000217217 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm7557-201ENSMUST00000221935 865 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm10705-201ENSMUST00000098980 461 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Olfr1384-202ENSMUST00000213776 4437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Siglec1-201ENSMUST00000028794 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Tiam1-213ENSMUST00000163370 7255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 AC154461.6-201ENSMUST00000224815 2630 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Atp6v1g3-201ENSMUST00000027643 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm27008-201ENSMUST00000182400 1360 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 C630043F03Rik-201ENSMUST00000122923 2581 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Vmn2r97-201ENSMUST00000168710 2586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm14106-201ENSMUST00000119382 438 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm24745-201ENSMUST00000157840 85 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Srsx-201ENSMUST00000171714 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm37839-201ENSMUST00000192576 492 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Rrh-205ENSMUST00000196902 1250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm19182-201ENSMUST00000207139 577 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm38843-201ENSMUST00000209189 323 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 AC158955.1-201ENSMUST00000227140 385 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm10064-201ENSMUST00000071235 399 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Olfr205-201ENSMUST00000074125 990 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gal3st2c-201ENSMUST00000097632 9667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Dnah10-203ENSMUST00000141137 13862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm42609-201ENSMUST00000196362 3306 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Bivm-201ENSMUST00000035991 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Psd3-202ENSMUST00000059374 2876 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Rere-201ENSMUST00000105680 6503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Pcbp2-203ENSMUST00000108838 2775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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NipblQ6KCD5 Fer1l6-203ENSMUST00000161028 5714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Dpy19l1-201ENSMUST00000115277 4747 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Atp6v0d2-201ENSMUST00000029900 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Rlim-202ENSMUST00000121153 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Utp14b-201ENSMUST00000053760 7393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm10309-201ENSMUST00000095186 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Oat-rs1-201ENSMUST00000122186 1311 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Cfhr2-201ENSMUST00000094489 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Fmo5-203ENSMUST00000107050 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Nav1-201ENSMUST00000040599 12767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm14325-202ENSMUST00000150650 310 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Sptssb-202ENSMUST00000171529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Olfr1252-201ENSMUST00000186710 1099 ntAPPRIS P1 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 AV026068-209ENSMUST00000189143 517 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Mrgprc3-ps-201ENSMUST00000189876 955 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm43688-201ENSMUST00000202249 310 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Akr1c13-201ENSMUST00000021634 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 AC108846.4-201ENSMUST00000216783 341 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 AC124826.1-201ENSMUST00000221651 325 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Gm17690-201ENSMUST00000180958 3467 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
NipblQ6KCD5 Akap2-206ENSMUST00000107598 6830 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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