Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm15402-201ENSMUST00000114051 670 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm22676-201ENSMUST00000116972 129 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm15660-201ENSMUST00000118997 478 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm13473-201ENSMUST00000119289 367 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm18407-201ENSMUST00000192126 790 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Rnase2a-201ENSMUST00000061936 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 D930016D06Rik-202ENSMUST00000181620 3805 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 9930038B18Rik-201ENSMUST00000151816 3966 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Sgo1-201ENSMUST00000024736 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 AC140299.2-201ENSMUST00000219546 1969 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Chrm3-201ENSMUST00000063093 1770 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Ank3-215ENSMUST00000182269 4411 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Cep85l-204ENSMUST00000220376 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Eif4e-201ENSMUST00000029803 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Olfr363-ps-201ENSMUST00000119049 254 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm13040-202ENSMUST00000169056 2104 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm25019-201ENSMUST00000179732 110 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Cacna1c-207ENSMUST00000186889 13162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm28066-201ENSMUST00000188657 472 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm37591-201ENSMUST00000193283 650 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm43522-202ENSMUST00000200185 442 ntTSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm7435-201ENSMUST00000214039 486 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm5662-201ENSMUST00000101168 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Wdr12-201ENSMUST00000027173 10012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Nxpe4-203ENSMUST00000216998 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Kcnj16-206ENSMUST00000180023 3701 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Fbxo16-204ENSMUST00000226005 3700 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Hgf-201ENSMUST00000030683 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Wap-201ENSMUST00000102910 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Ghr-202ENSMUST00000110697 1213 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm13740-201ENSMUST00000120590 310 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Tnik-211ENSMUST00000161964 3807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm9006-201ENSMUST00000165520 841 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm10603-203ENSMUST00000184875 508 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 AL607142.1-201ENSMUST00000226560 78 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 AC110043.1-201ENSMUST00000220278 1627 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Olfr720-202ENSMUST00000206298 4437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Plekhm3-201ENSMUST00000097713 8562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm26523-201ENSMUST00000180713 1658 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Stk32a-201ENSMUST00000045477 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm37367-201ENSMUST00000191771 2602 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Fpr3-202ENSMUST00000115565 1220 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Oosp3-202ENSMUST00000119053 621 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm11376-201ENSMUST00000144541 231 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm12753-201ENSMUST00000152086 653 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm37341-201ENSMUST00000194680 371 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm19590-201ENSMUST00000201551 1195 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm45075-201ENSMUST00000208426 649 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Fpr3-201ENSMUST00000054871 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Olfr599-201ENSMUST00000098201 1050 ntAPPRIS P1 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Defa23-201ENSMUST00000098899 411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Prickle2-204ENSMUST00000113447 7679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Spag9-201ENSMUST00000024979 6756 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Hrh2-202ENSMUST00000209846 4074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Redrum-201ENSMUST00000181269 1774 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Trim16-203ENSMUST00000108703 3574 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Zfand6-201ENSMUST00000069537 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Dab2-201ENSMUST00000078019 3793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Zfp27-202ENSMUST00000159920 3381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Ccdc18Q640L5 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms