Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 B3gntl1-202ENSMUST00000067399 2864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Nsun2-201ENSMUST00000022087 4164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 1700027J07Rik-203ENSMUST00000217501 1884 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 4932431P20Rik-202ENSMUST00000141713 9288 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Plat-201ENSMUST00000033941 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm36799-201ENSMUST00000214113 1737 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Ptpre-204ENSMUST00000209979 4959 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Olfr825-203ENSMUST00000216530 3502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Rbms3-205ENSMUST00000111772 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Naip1-204ENSMUST00000222155 5361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 D430018E03Rik-201ENSMUST00000181842 3832 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Amd1-201ENSMUST00000099945 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Cep70-201ENSMUST00000093795 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm15950-201ENSMUST00000162902 1973 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gem-201ENSMUST00000029868 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Wdr59-203ENSMUST00000211981 3618 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Rreb1-203ENSMUST00000110238 7437 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Slit2-208ENSMUST00000173107 9960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1532-ps1-202ENSMUST00000207492 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1532-ps1-203ENSMUST00000215949 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Adtrp-201ENSMUST00000072012 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm9936-201ENSMUST00000201635 2925 ntAPPRIS P1 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Olfr300-ps1-201ENSMUST00000174262 2395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Sorbs1-212ENSMUST00000225148 2379 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Spaca7-201ENSMUST00000010579 762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm12937-201ENSMUST00000118333 448 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm12787-201ENSMUST00000119234 396 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm12638-201ENSMUST00000119531 298 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Klrc2-204ENSMUST00000119533 717 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm15106-201ENSMUST00000119691 821 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm12189-201ENSMUST00000119779 912 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm2768-201ENSMUST00000121062 250 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm14980-201ENSMUST00000121247 736 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm371-201ENSMUST00000142240 1245 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm24530-201ENSMUST00000157948 288 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Tmem258-204ENSMUST00000166412 447 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Vmn2r-ps70-201ENSMUST00000174636 302 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm24897-201ENSMUST00000179033 107 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Scgb2b17-202ENSMUST00000182640 420 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Scgb2b17-203ENSMUST00000182673 434 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Scgb2b15-201ENSMUST00000182975 434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 1700016L21Rik-201ENSMUST00000187497 394 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm29423-207ENSMUST00000189580 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Ly96-202ENSMUST00000190366 429 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 AC069561.3-201ENSMUST00000217321 114 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 AC166341.3-201ENSMUST00000221861 114 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 AC154472.1-201ENSMUST00000222663 236 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 AC069562.1-201ENSMUST00000224206 434 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm20900-201ENSMUST00000078729 472 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm26264-201ENSMUST00000083278 159 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Tgs1-201ENSMUST00000052712 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Acsl6-204ENSMUST00000093106 5804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Zfp963-201ENSMUST00000130458 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Rpgr-205ENSMUST00000115533 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 AC101875.1-201ENSMUST00000222666 2223 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Arl13a-201ENSMUST00000064476 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Ambra1-201ENSMUST00000045699 4690 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Abhd2-201ENSMUST00000037315 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Pik3c3-202ENSMUST00000115811 3084 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 4931406B18Rik-208ENSMUST00000191516 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Ikbkg-217ENSMUST00000164101 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Ikbkg-218ENSMUST00000180230 6785 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 4933421A08Rik-201ENSMUST00000135313 1638 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm16233-201ENSMUST00000136170 1623 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Epn2-201ENSMUST00000001063 4243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Foxp3-203ENSMUST00000115739 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Sars-201ENSMUST00000090553 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Mroh4-202ENSMUST00000137963 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Atf6-201ENSMUST00000027974 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Synj2-207ENSMUST00000115788 3498 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl32-202ENSMUST00000220621 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc18-201ENSMUST00000038956 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Olfr97-203ENSMUST00000213328 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Olfr807-203ENSMUST00000217106 1788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Zfp939-201ENSMUST00000061201 2131 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Cttnbp2-201ENSMUST00000090601 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Rnase6-202ENSMUST00000226194 2452 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Pik3cg-202ENSMUST00000085469 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Lrrc43Q3V0L5 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms