Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 AC125064.1-201ENSMUST00000225801 295 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
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Gm28047Q3US59 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Spink14-201ENSMUST00000060328 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm14851-201ENSMUST00000077452 351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Gm28047Q3US59 Csnk1g1-201ENSMUST00000034949 7208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Gm28047Q3US59 Cyp2j11-201ENSMUST00000015368 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Gm28047Q3US59 Glmn-203ENSMUST00000100949 1759 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
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Gm28047Q3US59 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Nipa2-203ENSMUST00000119041 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Fmr1-203ENSMUST00000114654 4061 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Vmn1r90-201ENSMUST00000185220 7144 ntAPPRIS P2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Olfr1111-203ENSMUST00000216378 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Cul5-202ENSMUST00000120122 5945 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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Gm28047Q3US59 Gm29061-201ENSMUST00000185900 1499 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm29321-201ENSMUST00000186727 1499 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm43873-201ENSMUST00000204505 3938 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Scyl3-203ENSMUST00000161908 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Slamf7-202ENSMUST00000192024 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm43845-201ENSMUST00000202462 1820 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 St18-204ENSMUST00000131494 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Apol10a-201ENSMUST00000060551 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Olfr1293-ps-201ENSMUST00000102551 888 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm14904-201ENSMUST00000117067 335 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gimap4-204ENSMUST00000119575 900 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 4933417A18Rik-201ENSMUST00000160279 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Igkv2-95-2-201ENSMUST00000166362 222 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Plce1-203ENSMUST00000182267 7234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
Gm28047Q3US59 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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