Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Mrgprb5-201ENSMUST00000094389 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Mttp-201ENSMUST00000029805 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Asap1-210ENSMUST00000176384 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 D630023O14Rik-201ENSMUST00000191913 3099 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Emsy-207ENSMUST00000205911 5079 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm8177-201ENSMUST00000181591 1336 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Zfhx4-203ENSMUST00000175866 11287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Mettl4-201ENSMUST00000171284 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Olfr947-ps1-201ENSMUST00000214075 2165 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm28993-201ENSMUST00000186236 1499 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm37870-201ENSMUST00000192349 1499 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm37467-202ENSMUST00000192785 1499 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm37252-201ENSMUST00000195063 1499 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm38013-202ENSMUST00000195453 1499 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm37286-201ENSMUST00000195885 1499 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm12324-201ENSMUST00000130837 3753 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Cdh8-201ENSMUST00000093249 3790 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm5431-203ENSMUST00000109212 3063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Uba1y-201ENSMUST00000115894 3981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 AC140393.3-201ENSMUST00000228396 1352 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm26806-201ENSMUST00000180403 1519 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Fundc2-201ENSMUST00000033541 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Olfr1387-202ENSMUST00000214541 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Igkv4-50-201ENSMUST00000103363 352 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm12842-201ENSMUST00000117298 476 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm7113-201ENSMUST00000120477 958 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm12307-201ENSMUST00000120581 590 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm8722-201ENSMUST00000121466 769 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm12531-201ENSMUST00000126099 487 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 1700047F07Rik-201ENSMUST00000140321 543 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Tnfsf13os-201ENSMUST00000140371 816 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm15322-201ENSMUST00000142621 739 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm13179-202ENSMUST00000151994 978 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 1700057H21Rik-201ENSMUST00000152467 383 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm38068-201ENSMUST00000192546 540 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm42443-201ENSMUST00000198084 1155 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm42983-201ENSMUST00000199879 815 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm43263-201ENSMUST00000201619 560 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 1700028E10Rik-204ENSMUST00000201853 767 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Mat2a-206ENSMUST00000206692 1400 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm8291-201ENSMUST00000209635 1261 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Olfr118-202ENSMUST00000215811 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 4930486F22Rik-201ENSMUST00000218077 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 4930545H06Rik-201ENSMUST00000218225 763 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm40932-202ENSMUST00000221315 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 AC154248.1-201ENSMUST00000222072 495 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 AC122533.1-201ENSMUST00000225177 767 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Ddx4-201ENSMUST00000075748 2762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Olfr594-201ENSMUST00000098205 1087 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Bbx-203ENSMUST00000089404 4024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Cts8-201ENSMUST00000021891 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm45493-201ENSMUST00000209494 3948 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Casp1-201ENSMUST00000027015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Frem2-201ENSMUST00000091137 12348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Crem-230ENSMUST00000151311 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm35256-201ENSMUST00000212780 3269 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Wdr64-202ENSMUST00000171939 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm37769-201ENSMUST00000193753 2369 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Sh3bp1P55194 Pou2f1-205ENSMUST00000111427 13050 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 AC158595.1-201ENSMUST00000217989 1435 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm37833-201ENSMUST00000194342 3256 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm26079-201ENSMUST00000104066 133 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm21637-201ENSMUST00000105124 778 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm4985-201ENSMUST00000118300 1233 ntAPPRIS P1 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm11445-201ENSMUST00000119101 532 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm12813-201ENSMUST00000119615 902 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Rps13-ps6-201ENSMUST00000120038 428 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm12082-201ENSMUST00000138164 600 ntTSL 3 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm13211-201ENSMUST00000141649 697 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 4930532G15Rik-201ENSMUST00000180632 699 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm27468-201ENSMUST00000183577 106 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm28620-201ENSMUST00000190463 439 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm29508-202ENSMUST00000191414 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Igkv4-83-201ENSMUST00000196933 334 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Sh3bp1P55194 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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