Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm7982-202ENSMUST00000136313 1536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Chrnb3-201ENSMUST00000060943 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Spag9-204ENSMUST00000092777 6913 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 D330045A20Rik-201ENSMUST00000046763 3737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Slco1a4-201ENSMUST00000032364 2252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Zfp661-202ENSMUST00000110366 4912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Atrx-201ENSMUST00000101305 2903 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Fxyd1-203ENSMUST00000108110 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm14580-201ENSMUST00000119122 718 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm12873-201ENSMUST00000119988 422 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm10601-201ENSMUST00000120436 1422 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 1700073E17Rik-202ENSMUST00000146858 382 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm22035-201ENSMUST00000157284 228 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm23591-201ENSMUST00000157663 286 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Ly6k-202ENSMUST00000168815 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Cd200r3-210ENSMUST00000171779 1223 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm5947-201ENSMUST00000179156 714 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm5645-201ENSMUST00000179597 714 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm38122-201ENSMUST00000192679 885 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Epyc-201ENSMUST00000020094 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Hoxd9P28357 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Olfr1311-201ENSMUST00000208536 943 ntAPPRIS P1 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Recql5-201ENSMUST00000021097 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm31045-201ENSMUST00000211266 922 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Hoxd9P28357 AC162376.1-201ENSMUST00000220120 435 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 AC162183.1-202ENSMUST00000225434 904 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Diaph3-204ENSMUST00000226254 682 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
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Hoxd9P28357 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Pp2d1-201ENSMUST00000056198 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Mfap1b-201ENSMUST00000056732 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Hoxd9P28357 Prkacb-201ENSMUST00000005164 4001 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm14002-201ENSMUST00000123574 2839 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Hoxd9P28357 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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Hoxd9P28357 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gstz1-201ENSMUST00000063117 1656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Sorbs2os-201ENSMUST00000135116 2474 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Pls3-204ENSMUST00000114059 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Pnisr-202ENSMUST00000098238 4407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 C230079O03Rik-201ENSMUST00000209560 1385 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm42676-201ENSMUST00000197609 2686 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Olfr305-203ENSMUST00000213869 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Golph3l-202ENSMUST00000098861 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Olfr799-205ENSMUST00000217364 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Gm45250-201ENSMUST00000209414 3592 ntBASIC6.96□□□□□ -1.29
Hoxd9P28357 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm12193-201ENSMUST00000117250 379 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
Hoxd9P28357 Gm12492-201ENSMUST00000117665 564 ntBASIC6.96□□□□□ -1.3
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