Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 4921511C10Rik-201ENSMUST00000200412 1463 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Ighv1-16-201ENSMUST00000103501 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Ighv1-24-201ENSMUST00000103509 294 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Skint1-201ENSMUST00000117379 875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Gm8312-201ENSMUST00000119380 618 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Gm11485-201ENSMUST00000120048 1175 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Gm15596-201ENSMUST00000121139 784 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Gm13480-201ENSMUST00000125095 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 4930587A21Rik-201ENSMUST00000128588 851 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Fam229b-205ENSMUST00000135785 674 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Gm13807-201ENSMUST00000137073 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Scnm1-202ENSMUST00000173462 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 1700003H04Rik-203ENSMUST00000178485 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Gm5225-201ENSMUST00000178572 324 ntAPPRIS P1 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Lax1-202ENSMUST00000189524 628 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 AC099760.1-201ENSMUST00000196300 153 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Mark1-ps1-201ENSMUST00000198516 717 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Ighv1-83-201ENSMUST00000199643 351 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Gm44374-201ENSMUST00000199821 140 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Smarca2-231ENSMUST00000208091 1140 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Gm45602-202ENSMUST00000211703 1036 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Gm35188-201ENSMUST00000218869 535 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 4930522N08Rik-201ENSMUST00000031274 916 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Vmn2r42-201ENSMUST00000086282 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Rc3h1-201ENSMUST00000035911 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Zfp867-201ENSMUST00000057799 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Chd9-201ENSMUST00000048665 12008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Ttll6-202ENSMUST00000167258 3205 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Mbnl1-214ENSMUST00000193517 5151 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Gm21818J3KMS6 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Zfp473-203ENSMUST00000120074 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Olfr1270-203ENSMUST00000215578 4982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Olfr259-203ENSMUST00000215828 4095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Asah2-201ENSMUST00000096119 4682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Serpinb6e-201ENSMUST00000110275 1494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Sirpb1c-201ENSMUST00000050623 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Nlgn1-201ENSMUST00000075054 4359 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Sirpb1c-204ENSMUST00000108352 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Akap11-201ENSMUST00000022593 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Kif2a-204ENSMUST00000122233 3533 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Olfr537-ps1-201ENSMUST00000209871 2792 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Olfr916-202ENSMUST00000213714 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Ktn1-224ENSMUST00000191018 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Sgip1-202ENSMUST00000072481 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Atp6ap1l-201ENSMUST00000109541 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Myl2-202ENSMUST00000111750 729 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm15181-201ENSMUST00000120142 177 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm12451-201ENSMUST00000121636 633 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Rpl35a-ps5-201ENSMUST00000137013 333 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm14349-201ENSMUST00000137155 902 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm25374-201ENSMUST00000158158 101 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Lrrc4-202ENSMUST00000171353 883 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Obox1-202ENSMUST00000172463 783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm10428-201ENSMUST00000178750 399 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm8367-201ENSMUST00000186145 887 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm28086-201ENSMUST00000191586 317 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm17934-201ENSMUST00000192818 422 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm1969-201ENSMUST00000198125 1220 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 4930480K02Rik-201ENSMUST00000203679 1054 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Mageb16-ps2-201ENSMUST00000204513 1093 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Fxyd1-212ENSMUST00000206305 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Olfr1476-ps1-201ENSMUST00000208572 367 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm9535-201ENSMUST00000218499 768 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm36607-201ENSMUST00000222750 1087 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 CT030195.1-201ENSMUST00000223887 378 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 AC133203.1-201ENSMUST00000228241 301 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Olfr1079-201ENSMUST00000099882 948 ntAPPRIS P2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm10295-201ENSMUST00000094315 2525 ntAPPRIS P1 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Tet1-201ENSMUST00000050826 13986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 CT025686.2-201ENSMUST00000227898 3315 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Gm13119-201ENSMUST00000094526 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Gm21818J3KMS6 Olfr736-204ENSMUST00000215227 2485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms