Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Vps50-203ENSMUST00000170873 3687 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Sh2d1b1-201ENSMUST00000179976 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 4933400A11Rik-203ENSMUST00000112102 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Tctex1d1-203ENSMUST00000125417 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm9027-201ENSMUST00000165914 661 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm5624-202ENSMUST00000178184 492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm28228-201ENSMUST00000186880 632 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm4322-201ENSMUST00000191094 336 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm45196-201ENSMUST00000206751 825 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 AC211878.6-201ENSMUST00000221896 358 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm34557-201ENSMUST00000223115 375 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Ctag2-201ENSMUST00000033524 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Olfr796-201ENSMUST00000037071 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Armc4-201ENSMUST00000081275 3477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm37943-201ENSMUST00000194053 3944 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Olfr633-202ENSMUST00000216006 3915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Olfr734-203ENSMUST00000217152 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Cdc42bpa-201ENSMUST00000076687 4917 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Pramef8-201ENSMUST00000037356 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Hapln1-201ENSMUST00000022108 5715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm12018-201ENSMUST00000150694 3375 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm29274-202ENSMUST00000188814 1498 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Xpo1-203ENSMUST00000102870 3471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Irgm2-202ENSMUST00000108836 3459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Irgm2-201ENSMUST00000058704 3470 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm5832-201ENSMUST00000121704 1582 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 AC121997.2-201ENSMUST00000228095 2294 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Impact-201ENSMUST00000025290 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm7146-201ENSMUST00000116079 739 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm16074-201ENSMUST00000119524 444 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm7931-201ENSMUST00000121537 271 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Rpl29-ps5-201ENSMUST00000164794 477 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Mup7-203ENSMUST00000166098 1033 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm42916-201ENSMUST00000197142 1042 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm44463-201ENSMUST00000198895 137 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm42205-201ENSMUST00000199244 804 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 2310008N11Rik-204ENSMUST00000210955 457 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm8863-201ENSMUST00000216630 926 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 AC165256.1-201ENSMUST00000216687 670 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 AC159622.2-201ENSMUST00000221592 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Gm10095-201ENSMUST00000222765 483 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 AC163743.1-201ENSMUST00000224309 270 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Mup4-201ENSMUST00000075973 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Ceacam13-201ENSMUST00000081703 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Vaultrc5-201ENSMUST00000083211 143 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Taar4-201ENSMUST00000092660 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Clcn5-201ENSMUST00000004428 8390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Grik3B1AS29 Atp8b4-202ENSMUST00000040149 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 9830144P21Rik-202ENSMUST00000127525 3362 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm7980-201ENSMUST00000168107 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm37735-201ENSMUST00000193995 1406 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm5949-201ENSMUST00000213468 1421 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 9830004L10Rik-201ENSMUST00000185548 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Vmn2r44-201ENSMUST00000166499 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Ift80-201ENSMUST00000029347 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Pus10-203ENSMUST00000109525 3177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Fstl5-203ENSMUST00000160261 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm3259-202ENSMUST00000160045 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 C87414-201ENSMUST00000076321 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm45671-201ENSMUST00000210229 3920 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Mcoln3-201ENSMUST00000039450 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm20716-201ENSMUST00000138667 5288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Iqca-201ENSMUST00000113094 3210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Crtam-203ENSMUST00000180872 4443 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 CT025660.2-201ENSMUST00000217654 3539 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 AC192333.5-201ENSMUST00000224620 2350 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm14529-201ENSMUST00000117894 406 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm12399-201ENSMUST00000121475 446 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm22276-201ENSMUST00000122469 129 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm13029-201ENSMUST00000137283 594 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm15063-201ENSMUST00000152648 895 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm23995-201ENSMUST00000158060 129 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm16557-201ENSMUST00000159182 191 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Grik3B1AS29 Gm6541-201ENSMUST00000165542 561 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms