Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gab3-203ENSMUST00000114109 2093 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm3453-201ENSMUST00000170686 1756 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Wars2-201ENSMUST00000004343 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Svil-215ENSMUST00000210707 7633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Sirpb1b-202ENSMUST00000192382 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Enpp3-201ENSMUST00000020169 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 AC155255.1-201ENSMUST00000218751 1428 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 AC136019.1-201ENSMUST00000226503 1412 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm14391-203ENSMUST00000109056 1956 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Glb1l3-203ENSMUST00000210274 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Entpd5-202ENSMUST00000072061 4858 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Zfp488-201ENSMUST00000166737 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Zfp788-203ENSMUST00000100275 3177 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm36660-201ENSMUST00000218323 3871 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Magea6-202ENSMUST00000112562 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Rhox3b-ps-201ENSMUST00000121045 868 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm26489-201ENSMUST00000157880 264 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 7630403G23Rik-201ENSMUST00000184229 1084 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28610-201ENSMUST00000187716 406 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm28835-201ENSMUST00000188415 655 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 4933436F18Rik-201ENSMUST00000193468 802 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm43973-201ENSMUST00000203562 210 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm8039-201ENSMUST00000204758 712 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm18587-201ENSMUST00000213736 841 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Ss18l2-204ENSMUST00000215104 315 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 CT025660.1-201ENSMUST00000216094 457 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 4930591A17Rik-201ENSMUST00000041998 737 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Magea6-201ENSMUST00000076986 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Adgrl2-212ENSMUST00000198779 4592 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Sptssb-201ENSMUST00000051239 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Cep57l1-204ENSMUST00000186239 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Wdr72-205ENSMUST00000215440 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Tcp1-ps1-201ENSMUST00000120941 1466 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Olfr615-202ENSMUST00000214345 3403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 B230354K17Rik-201ENSMUST00000181149 4897 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Epb41-201ENSMUST00000030739 6565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Cyp2c50-201ENSMUST00000068094 1643 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Trim66-202ENSMUST00000106739 9250 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Cd274-201ENSMUST00000016640 3622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Nwd1-209ENSMUST00000228312 10789 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Muc19-202ENSMUST00000160242 9104 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 4931406B18Rik-201ENSMUST00000013497 3970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 AC123954.1-201ENSMUST00000222404 3272 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gprasp1-203ENSMUST00000113147 5611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm10269-201ENSMUST00000165229 372 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm29124-201ENSMUST00000186576 452 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm18427-201ENSMUST00000195422 515 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 AC134537.2-201ENSMUST00000217770 575 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Olfr19-201ENSMUST00000057886 1142 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Bglap-201ENSMUST00000076048 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm8412-201ENSMUST00000077493 440 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Thap6-201ENSMUST00000191860 3151 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Pan2-206ENSMUST00000219721 4316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Grm8-202ENSMUST00000115323 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Zfa-ps-202ENSMUST00000180673 3420 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Trps1-203ENSMUST00000183421 3446 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Olfr958-203ENSMUST00000217227 3831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Muc6-203ENSMUST00000190907 8757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Rapgef4-203ENSMUST00000102698 2982 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Plch1-201ENSMUST00000048134 6259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Sgip1-203ENSMUST00000080728 3712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r-ps96-201ENSMUST00000221218 2545 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm44022-201ENSMUST00000203708 5429 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Atl3-201ENSMUST00000025668 6376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Olfr119-201ENSMUST00000080483 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm19272-202ENSMUST00000185181 2217 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r22-206ENSMUST00000228905 2394 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm15044-201ENSMUST00000120703 598 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Smyd1-204ENSMUST00000129630 376 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Pantr1-203ENSMUST00000176154 514 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Rps12-ps24-201ENSMUST00000182321 381 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm30928-201ENSMUST00000205858 459 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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