Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Gm15922-201ENSMUST00000118068 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Vmn1r220-205ENSMUST00000228239 7849 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC6.38□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Ppp2r3a-201ENSMUST00000066773 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Pign-206ENSMUST00000187537 4006 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Bclaf1-203ENSMUST00000185800 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Mttp-202ENSMUST00000098580 3072 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Ncoa7-208ENSMUST00000215926 2875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 E030022I16Rik-201ENSMUST00000215131 2766 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Adam4-201ENSMUST00000085319 2504 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm42992-201ENSMUST00000197043 6836 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm12794-201ENSMUST00000052027 1452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm45179-201ENSMUST00000208452 4337 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Hsd3b3-202ENSMUST00000094050 1327 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm13770-201ENSMUST00000117149 305 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm12140-201ENSMUST00000121214 544 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm15618-201ENSMUST00000121610 452 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm11734-201ENSMUST00000132261 728 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm9671-201ENSMUST00000171502 547 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm20643-201ENSMUST00000177284 322 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm20620-201ENSMUST00000177528 168 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Mir6992-201ENSMUST00000183342 109 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 9430087J23Rik-201ENSMUST00000195414 1152 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm2602-201ENSMUST00000202112 571 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Olfr162-ps1-201ENSMUST00000206015 934 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm34829-202ENSMUST00000216017 1131 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 AC154633.1-201ENSMUST00000223276 449 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 AC170810.1-201ENSMUST00000228267 672 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 4930550C14Rik-201ENSMUST00000005262 1237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 BC061237-201ENSMUST00000096899 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Vmn1r168-201ENSMUST00000098704 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Phf6-203ENSMUST00000154864 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm37023-201ENSMUST00000192895 2426 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Kcnma1-202ENSMUST00000074983 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm37685-201ENSMUST00000193507 2177 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm37142-201ENSMUST00000193718 3110 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Ccdc7a-205ENSMUST00000214889 5544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Prcp-201ENSMUST00000076052 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm3159-202ENSMUST00000167245 1797 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Myct1-201ENSMUST00000051809 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 1500004A13Rik-203ENSMUST00000183966 3743 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 AC151530.1-203ENSMUST00000223343 2591 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Scp2-ps2-203ENSMUST00000216438 1370 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Olfr1033-203ENSMUST00000214546 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Cd200r3-206ENSMUST00000114622 1339 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Mfap3-203ENSMUST00000108849 4827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Trbv4-201ENSMUST00000103265 393 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Foxp2-202ENSMUST00000115469 1293 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm13835-201ENSMUST00000118459 685 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm12631-201ENSMUST00000130576 637 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm26346-201ENSMUST00000157525 329 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 1700006E09Rik-203ENSMUST00000176722 608 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm29282-201ENSMUST00000190720 473 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm3351-201ENSMUST00000193454 505 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm35013-201ENSMUST00000197218 832 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Trav3n-2-201ENSMUST00000197693 334 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Trav3d-2-201ENSMUST00000199874 334 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm44940-201ENSMUST00000206225 1247 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Api5-ps-201ENSMUST00000206607 577 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm44955-201ENSMUST00000208843 229 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 BC024386-204ENSMUST00000209842 688 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 AC158630.1-201ENSMUST00000214387 993 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Nqo2-201ENSMUST00000021843 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm32172-201ENSMUST00000220029 633 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Tpbpb-203ENSMUST00000223978 991 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 AC113125.2-201ENSMUST00000226837 362 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Olfr732-201ENSMUST00000071208 1044 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Olfr487-201ENSMUST00000081996 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Nms-201ENSMUST00000088029 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Tnpo1-202ENSMUST00000109401 8453 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Slc39a12-201ENSMUST00000082290 2675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Prom1-216ENSMUST00000197750 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Scd4-201ENSMUST00000058856 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Cc2d2b-205ENSMUST00000224596 4762 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Il18r1-205ENSMUST00000193793 1652 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Hnf4g-202ENSMUST00000108394 2327 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Naip5-201ENSMUST00000049789 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Zfp825-203ENSMUST00000221173 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Il1rapl1-201ENSMUST00000078875 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Olfr1036-201ENSMUST00000164985 3203 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Gm43328-201ENSMUST00000198544 1434 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
MesdQ9ERE7 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.4 ms